Mapother, nascido a 12 de julho de 1881 em Dublin, era filho de Edward Dillon Mapother, professor de anatomia e presidente do Colégio Real de Cirurgia da Irlanda. Depois de estudar na Inglaterra, no University CoIlege, e de receber uma formação neurológica que influenciaria o seu olhar sobre a psiquiatria, tomou-se em 1908 assistente em Long Grove, asilo do condado de Londres aberto em Epsom no ano precedente. Mobilizado em 1914, encontrou em 1919 Frederick Mott no Maudsley Hospital, ainda ocupado por pacientes "neurológicos" que dependiam do Ministério dos Ex-Combatentes, o que o auxiliava no estudo das perturbações psíquicas de origem orgânica. Em janeiro de 1923, o Maudsley Hospital foi oficialmente inaugurado e teve enfim o destino psiquiátrico desejado por seu "criador"; Mapother foi o seu primeiro médico-diretor. No ano anterior, fez uma viagem de estudos pelo continente: Munique, o Hospital Burghölzli, Colônia, Amsterdã, Utrecht. Desejava organizar o estabelecimento segundo o modelo kraepeliniano reunindo um serviço universitário de 1m centro de pesquisas comparável Forschungsanstalt de Munique.
Em 1924, o Maudsley Hospital foi autorizado a conceder o diploma de especialista em psiquiatria, mas seria preciso esperar até novembro de 1936 para que uma cátedra de psiquiatria fosse oficialmente criada, a primeira do Reino Unido. Foi atribuída conjuntamente a Mapother e a Golla, sucessor de Mott à frente do laboratório de anatomia patológica, pois o Maudsley conservava uma orientação muito organicista e "científica", que o opunha às concepções psicogenéticas e sociogenéticas da Tavistock Clinic, de onde sairiam certos contestatários do movimento antipsiquiátrico inglês de Laing e Cooper.